Métabolisme des virus

Métabolismes énergétiques microbiens :

Evolution de la vie :[pic 1]

-Apparition des premiers organismes vivants : environ 3.8 MA (à l’origine de la vie, il y avait que des procaryotes).

Durée gigantesque de l’adaptation des procaryotes.

- Co-évolution biosphère et géosphère

-adaptation progressive aux facteurs de l’environnement (biotiques et abiotiques)                              

=diversité et flexibilité considérable du métabolisme microbien                                                              

=meilleurs colonisateurs de notre planète

Intérêt biotechnologique :

• Protection des aliments (les gens avaient tendance à protéger les aliments en les salant)
• Production agroalimentaire (alcool…) = fermentation
• Bioremédiation/bioréhabilitation/biolixiviation… (= les micro-organismes servent à décontaminer les lieux très pollués)

Résumé des réactions cellulaires de synthèse et biodégradation :

Anabolisme : ensemble de toutes les réactions de biosynthèse des cellules.                                                               Certaines bactéries n’ont pas un cycle de krebs complet.

Métabolismes énergétiques :

Catabolisme : ensemble de toutes les réactions conduisant à la production de l’énergie utilisable par les cellules (généralement sous forme d’ATP). Il existe autre forme d’énergies (NADH, FADH…).

• Prototrophes : poussent sur milieu minimum (synthétisent AA, bases azotées, vitamines)
• Auxotrophes : ne poussent pas sur milieu minimum quelle que soit la source de carbone (problème de biosynthèse) sauf si on leur donne une source de carbone approprié (problème de catabolisme : problème énergétique, problème du substrat qui ne peut pas etre dégradé)

Une diversité catabolique tres supérieure à celle du règne eucaryote :

1. Diversité des sources de carbone [pic 2]
2. Diversité des sources d’énergie                             types trophiques [pic 3][pic 4]
3. Diversité des sources d’électrons
4. Diversité des comportements vis-à-vis de l’oxygène

Types trophiques :

• Source de carbones : autotrophes                  CO2

                                      Hétérotrophe               autre(s) que CO2 (différents niveaux redox)

• Source d’énergie :      phototrophes                 lumière (photosynthèse)

                                      Chimiotrophes              oxydation de composés organiques/inorganiques

• Source d’électrons :   lithotrophes                 molécules inorganiques (réduites)

                                      Organotrophes            molécules organiques (réduites)

5 types nutritionnels majeurs :

• Photo-lithotrophes autotrophes : cyanobactéries, bactéries sulfureuses pourpres et vertes
• Chimio-organotrophes hétérotrophes : microbiotes animales, pathogènes…
• Photo-organotrophes hétérotrophes : bactéries non sulfureuses pourpres et vertes
• Chimio-lithotrophes autotrophes : bactéries oxydant le soufre, l’hydrogène ou le fer, bactéries nitrifiantes
• Chimio-lithotrophes hétérotrophes

(Certaines bactéries peuvent avoir 2 types qui coexistent mais ne fonctionnent pas au meme moment)