Exposé: Étude Et Comparaison De Séquences d'Arn Et d'Adn

acccgcc ggtgcaggca gaacaatgct cagcccgcag ttgaaccagc actgtccttc tctggggacc tggaagctct gggaggcaga gcctgcagcc gtaccagcat gcagcccccc tgccatggcc tgacccagcc ctacctagtg ggacctgcag cttggccctg ctgctccctc acccgccgcc ctgtggatgc gcagcctttg tgcggggaac gtggggcagg gaggggtccc taccagctgg tcctgcaccg

¢  Le

premier ATG se trouve à partir du 45ème nucléotide. ¢  la position du site de polyadénylation est du 378ème nucléotide au 451ème nucléotide.

Exercice 1 1

¢  La

Exercice 2 2

Exercice 3 3

Exercice 4

Exercice 5 4

séquence peptidique du gène est obtenu grâce à l’outils de traduction EXPASY Tools: 5'3' Frame 3

C A E G L L I L R S E N R W G L N Q R G F Q Y G P F P C H D Y L N Q A H H C P S A Met P A A A F V N Q H L T P K T R R E A E D A L E G S L Q K R G Stop T Q P A G S P A C L I P L G Q V P W S V E A Met H L G Q Q C A S R V V C C L E E T T L A L S E P L G I R L Y G C D L L G S G A V P L I L C G Y K L G A Q P

Exercice 1 1

¢  Le

Exercice 2 2

Exercice 3 3

Exercice 4

Exercice 5 4

point isoélectrique et la masse moléculaire de la protéine ont été obtenu à partir de EXPASY computer pl/Mw:

Point isoélectrique théorique: 5.22 —  Masse moléculaire théorique 11980.91 Daltons

— 

Exercice 1 1 2

Exercice 2 3 4

Exercice 3 5 6

Exercice 4 7

Exercice 5 8 9

¢ 

Chez les volailles, on trouve une protéine transmembranaire sur pinéalocytes au niveau de la glande pinéale un photopigment proche de la rhodopsine, la pinopsine (≈38 kDa). La séquence d'acides aminés de la P-opsine est de 42 à 46 % identique à celles des opsines rétiniennes. La séquence primaire de pinopsine suggère qu’elle sera sensible à une lumière allant jusqu’à une longueur d’onde =500 nm et produit une réponse lente et prolongée à la phototransduction cohérent avec la fonction non visuels de la photoréception pinéale. Une étude menée sur des cailles du Japon a montré que la vitamine A était impliquée dans la réaction de la glande pinéale à la lumière. En cas de carence en vitamine A, la production de mélatonine est donc moins importante : la vitamine A joue un rôle essentiel dans l'intensité de la réponse de la glande pinéale à une stimulation lumineuse.

¢ 

¢ 

¢ 

Exercice 1 1

¢ 

Exercice 2 3 4

Exercice 3 5 6

Exercice 4 7

Exercice 5 8 9

2

La séquence la plus complète d’ARNm de la pinopsine de poulet est:

1 61 121 181 241 301 361 421 481 541 601 661 721 781 841 901 961 1021 1081 1141 1201 1261 1321 1381 1441 1501 1561 1621 1681 1741 1801 cagaacgcct acatgcacgc cacctgcatg ctcgctgcct gcaaaaggcg tggtttgtca gttggaacgg ttgtgctctc aacctctcct agagtccaac atcagaagcc tcttccctac ctgaaagcaa accatgtttg tcatatttgt ccatgaggat tggccgtcaa ttgtacgaag tcgtcgcgcc agaaatcgtc ctgtgtactt aaaaaggaag tctaaaccac caaagggctg agataccaaa ggccattggg ttgttccatt atatagagag atatttgtac cagcgtgttt tggggttccc tgtgcgcctt gtgcacaacc cacacaggtc tgcaattcag tcactaaaac gtctttgtgg ttgcgttctc tgacaacgca gctcccttct gaggtgccgg tttaaaccac agcttcagat tccgacctct atattggggc aatgcgttct gctcctggtg gaagtgatgg ccttttctaa cgccttgtga cttacctgca tttgtcagat aaaaagaggt tgcaagggga agagctttgc tctgagttcc gatgagccct gcaggcgctg agctataaat tgtctatttg atcgcatggc accgccacca acacacaccc acgtgcttgc cgactcctct tggcaaaaat atgggactat tttgggccta tggtaacgtg gctgggcctc gctctccctg cgggtgagaa agttcctttg ccgtgtagcc ggaaacctct tgggaggggg acagatatgc ctgccggggc gatggagcac gcggactgtc catgtttgat tcctaaggga ttgttaatat acagcttagg tcattctgca acagggactg cattaaggtt gcaaggccct tgaaggggca gtacggcttt tactctatat tttacaggca tcaccccgta acaggcatgc acacacgtgc cccagactcg gaatgcgtca tttaccgagg aacagtcttt ggaaggctgt cctgggatct caaacccttc ctctgccaaa gaagagctgc gtgtgcgcgt gttgactttt gaaatgttca atgggttata tgattttggg atcctgctgt cgtgcatccc accgatgttt attttgtatt ttataacgag agtctcgcct ctgcccgctc ccagggtgag gcatcactca gtgctgcact gacatatcac atgtttttgt caaacacagt gccccagcct ttgtgcccac acacgcatgc acacacacgc tcgccgtact gtcttgtgta ccgccgtgcc tatgcattta ttgcttttct gccacgagga cccagagcct tgctgcacct tgtcccgtcc gggtgtcgac ccaagttgcg tagggtcttt ctgggatgcc gtgcaggagc ggcacgtggg agctgcatgc tgctaccatg tcagcattat aacccaaaat tggccatacc ctttctgctg ggattaggca gaggcactgc caggccctgt cctggccctg agtagtggat gtggttatat ggggctctgg ggcagcaggc acacacacac! actcggcaca! gacttacctt! tctactgcga! ccgtccatgg! aagctcctct! tccagacagt! ataaagcagg! cccagcacac! tgccaggaat! ggtctcgatc! gacttccttt! atagcgttac! tttaataact! agcagcgtgc! tcatgcgaag! gttcctcact! agagcggtgg! tgaaggctgc! ctctctctct! aaaaagggga! acctaatgct! ggcagatccc! agggaggatt! atcagcagaa! tctgcatgaa! tccacactat! atatacttac! caacagtata! ctatggccac! tgcattgtca!

Exercice 1 1

¢ 

Exercice 2 3 4

Exercice 3 5 6

Exercice 4 7

Exercice 5 8 9

2

Suite de la séquence:

1861 1921 1981 2041 2101 2161 2221 2281 2341 2401 2461 2521 2581 2641 2701 2761 2821 2881 2941 3001 3061 3121 3181 3241 3301 3361 3421 3481 3541 3601 cagtggtgct aggtttttgg aaaaaaaaaa cacaaagctc gctccacggg caatgggacc atatgtgggg gctggtcatc ggtgaacctg caacaactct acaggcatcg tgcagacccc acgtggggct cctgaagggt agctacatcc tcctacacaa accacgcagc ctgctctgct atcatccagc aatcccatca tgctgtggtt gcagatgtca ctgcttcagc ggggacccag atagggtgaa gaagacaaaa caggctggct tccctatata acagtacaag actt! cacgtaacca cttaagccac aaaaaaggtg ctctctgggg cgctgtgctg ccagggcctt gtggccgtgc gtggtgtcca gccgtggctg tcgtgtttgg tggggctgtg tgggagattt gggcgctgct tgaggacatc tgtccctgtt acctgctgct gggcggagcg ggctgcccta cggtcctcgc tctacgtctt accagcccca ctgcagcggg acagcttcac cagcccagaa gcaccagtct cactgcagct ttatctggca gactgagttc agtcgatcag aacctattta cctttatccc aactattcag ctttataaag caggagcacc ttgatggccc tgatgggcac tctgctacaa acctgctggt caggaggatg gtcgctggcc ccagttccaa ctggagcacc gtgcgggcct tgtcacctgc gaccctgcgg ggaggtgacg cagcacgttt ctccttgcct catgaacaaa gcggacagga gctgaggaac caacacgggc cagcacagca ttatttcacc ccttttcctc cctgcaatgc tatatctgca gtatgtttag ctcgattaaa ctctggaata attaaaaaga aggaggcttt gatgtcctcc ccagtggccc ggtggtcgcc aaagctccgc gacgctgtgc tgtgagctgg atcctggccc cgtcggcacg ccaccactgc aactggtaca ttcgtcctgc gcggctgcag cggatggtga gccttggtgg tcctatttct cagttccaga aaagcctcac aaggtgatgc acaacggagg ttgccttctc cctctccttc catgcaacaa ttcacatagg ttgcctgagc gggcagactg tgaggcagaa aagagctgct aaaagcttaa tggggaggga aacagctccc taccaggccc tgtgcctcgg tccccactga ggcagctccg agggcttcat tggagcgcta cggtgagcgg tgggctggag cgggtggcag cgctcagcct cacagcagaa tcgtgatggt tggccaccca ccaagacagc gctgcctgct cggggacacc cagcacaccc gccagggagc gtgtcagaag agctcacctc atcacaagct aacaagacat ttgctatgaa cattaataaa ggcagacagc! tattaaaaaa! ggtgttccaa! tgtctgttgg! aggcacctcc! cacagagcac! tggtgaatgg! attacatcct! tcagcctctc! ggtctccttg! cgttgtggtc! ctgcgccttc! cagctacgtg! caacaacaac! catcctcttc! ggaagctgac! gatggccttc! taagggcatc! caccgtgtac! ggaaatgctg! tgggccccat! cgtgtgacct! agtgctccaa! agcccctggc! agccgatcag! tggctttgtg! acatctgctg! gccttaggtc! cagtaacaaa!

Exercice 1 1 2

Exercice 2 3 4

Exercice 3 5 6

Exercice 4 7

Exercice 5 8 9

¢ 

La position de la boite TATA est du 2064 au 2069ème nucléotide. La séquence de la boite TATA est tataa. La position du site +1 t est au 2103ème nucléotide. La séquence de la région 5'-UTR tccacgggcgctgtgctg caggagcaccg est du 2103 au 2131ème nucléotide. La position du codon start atg est du 2132 au 2134ème nucléotide. La position de la séquence du signal de poly-adénylation aataaa est du 3585 au 3590ème nucléotide. La position du site de poly-adénylation t est au 3604ème nucléotide.

¢ 

¢ 

¢ 

¢ 

¢ 

Exercice 1 1 2

Exercice 2 3 4